معاينه و آندوسكوپي
در مواردي كه تراكت سيتول سطحي باشد با لمس دقيق مي‌توان اين مسير را مشخص كرد كه معمولا در فيستول‌هاي اينتراسفنكتريك است. اين معاينه دو انگشتي كه انگشت شصت بيرون و سبابه داخل مقعد صورت مي‌گيرد كمك‌كننده مي‌باشد.در مورد تراكت‌هاي عمقي‌تر با سوراخ داخلي بالا اين روش چندان كمك‌كننده نيست.
در فيستول‌هاي ترانس اسفنكتريك با اكسترااسفنكتريك گاهي سوراخ خارجي از زير پوست تا اسكروتوم و پرينه كشيده مي‌شوند. در مواردي عمقي آندوسكوپي و پروبينگ آرام و ملايم تراكت فيستول خروج چرك از سوراخ داخل بالاي كريپت را در آنوسكوپي مشخص مي‌كند. هرگز نبايد پروب را با فشار وارد تراكت فيستول كرد چون يك مسير جديد فيستول ساخته مي‌شود.
معاينه و آندوسكوپي
در مواردي كه تراكت سيتول سطحي باشد با لمس دقيق مي‌توان اين مسير را مشخص كرد كه معمولا در فيستول‌هاي اينتراسفنكتريك است. اين معاينه دو انگشتي كه انگشت شصت بيرون و سبابه داخل مقعد صورت مي‌گيرد كمك‌كننده مي‌باشد.در مورد تراكت‌هاي عمقي‌تر با سوراخ داخلي بالا اين روش چندان كمك‌كننده نيست.
در فيستول‌هاي ترانس اسفنكتريك با اكسترااسفنكتريك گاهي سوراخ خارجي از زير پوست تا اسكروتوم و پرينه كشيده مي‌شوند. در مواردي عمقي آندوسكوپي و پروبينگ آرام و ملايم تراكت فيستول خروج چرك از سوراخ داخل بالاي كريپت را در آنوسكوپي مشخص مي‌كند. هرگز نبايد پروب را با فشار وارد تراكت فيستول كرد چون يك مسير جديد فيستول ساخته مي‌شود.
برخي جراحان براي مشخص كردن مسير داخلي فيستول حين عمل از تزريق موادي چون بلودومتيلن- شير- آب اكسيژنه كه آخري بيشتر مورد تاييد است و ضمن مشخص كردن سوراخ داخلي بافت را هم‌رنگي نكرده و مسير مخدوش نمي‌شود.
فيستولوگرافي
يك روش تشخيصي با تزريق ماده حاجب محلول در آب در مسير فيستول و راديوگرافي است كه اخيرا با سونوگرافي ترانس ركتال و MRT در حال جايگزيني است بيمار به پهلوي چپ خوابيده و پس از تزريق گرافي انجام مي‌شود. سونوگرافي ترانس ركتال معمولا در فيستول‌هايي كه سوراخ داخل معلوم نشده يا سابقه جراحي قبلي فيستول دارد و در بيماراني كه دچار كرون هستند و همچنين مشخصات فيستول نمايانگر فيستول بالا باشد، كمك مي‌كند.
در موارد فيستول‌هاي High يا كمپلكس و چند شاخه، بين تمام روش‌هاي ذكرشده MRI با كنتراست بهترين و دقيق‌ترين روش تشخيصي با 97 درصد حساسيت و 100 درصد اختصاصي است.